More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1114 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01745  serine protease  49.43 
 
 
942 aa  822    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  71.2 
 
 
970 aa  1285    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  100 
 
 
965 aa  1952    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  72.24 
 
 
970 aa  1271    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  70.04 
 
 
949 aa  1266    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  94.39 
 
 
909 aa  1711    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.3 
 
 
947 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.91 
 
 
926 aa  300  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.33 
 
 
915 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 
959 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.87 
 
 
913 aa  268  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.46 
 
 
906 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.4 
 
 
910 aa  263  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.37 
 
 
979 aa  230  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  29.32 
 
 
911 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  28.07 
 
 
974 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.51 
 
 
954 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.13 
 
 
1004 aa  178  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 
1033 aa  167  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  25.94 
 
 
1055 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.73 
 
 
1038 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.8 
 
 
991 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.08 
 
 
1028 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.28 
 
 
1125 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.45 
 
 
1001 aa  155  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.52 
 
 
995 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 
1006 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  26.32 
 
 
1001 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.87 
 
 
1134 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 
983 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.29 
 
 
710 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  27.44 
 
 
1154 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.17 
 
 
1446 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.58 
 
 
1156 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  23.6 
 
 
1179 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.41 
 
 
1325 aa  108  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.86 
 
 
816 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  29.72 
 
 
1175 aa  92.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  27.89 
 
 
1121 aa  89.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  36.11 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  33.73 
 
 
683 aa  84.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.58 
 
 
1011 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.48 
 
 
1177 aa  81.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 
1119 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.47 
 
 
995 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  35.15 
 
 
652 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  34.48 
 
 
652 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.55 
 
 
661 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.89 
 
 
754 aa  78.2  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.89 
 
 
1782 aa  77.8  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.67 
 
 
1532 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.34 
 
 
1322 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
718 aa  76.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.88 
 
 
1285 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  35.07 
 
 
653 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  35.07 
 
 
653 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  34.6 
 
 
653 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.39 
 
 
634 aa  75.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 
1848 aa  75.5  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  35.38 
 
 
1459 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.18 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.03 
 
 
770 aa  75.1  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  26.78 
 
 
1041 aa  74.7  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  26.78 
 
 
1041 aa  74.7  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.94 
 
 
986 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.68 
 
 
634 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.15 
 
 
1081 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.52 
 
 
398 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
848 aa  72.8  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.08 
 
 
972 aa  72  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  25.96 
 
 
2711 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.6 
 
 
760 aa  70.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.71 
 
 
1489 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.49 
 
 
1180 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.6 
 
 
597 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  25.43 
 
 
1129 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.65 
 
 
1066 aa  68.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.91 
 
 
1029 aa  68.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 
1011 aa  68.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  27.62 
 
 
485 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  27.63 
 
 
3506 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  24.47 
 
 
1130 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  32.46 
 
 
422 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  25 
 
 
1129 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.78 
 
 
919 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.5 
 
 
1508 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  25 
 
 
1131 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  25 
 
 
1131 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  25 
 
 
1131 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  25 
 
 
1131 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  25 
 
 
1131 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.63 
 
 
1694 aa  66.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  27.74 
 
 
814 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.47 
 
 
882 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  29.91 
 
 
641 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 
1060 aa  65.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  50 
 
 
670 aa  65.1  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.57 
 
 
449 aa  65.1  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.89 
 
 
452 aa  64.7  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>