107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0264 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 860 aa  1606    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.1 
 
 		 1029 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  45.42 
 
 		 550 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  53.92 
 
 		 422 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.53 
 
 		 1333 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  41.61 
 
 		 816 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1718  hypothetical protein  44.32 
 
 		 582 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  0.169106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  30.59 
 
 		 1327 aa  109  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  30.14 
 
 		 1806 aa  102  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  30.14 
 
 		 1297 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  27.41 
 
 		 1626 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  35.75 
 
 		 2003 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 		 1530 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  34.74 
 
 		 1180 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  42.86 
 
 		 3391 aa  86.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  36 
 
 		 36805 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.02 
 
 		 1081 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.31 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  32.17 
 
 		 3420 aa  79  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 		 1519 aa  78.2  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  38.76 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.26 
 
 		 3415 aa  77.4  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  44.44 
 
 		 1001 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  47.06 
 
 		 1869 aa  75.1  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  37.87 
 
 		 1028 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  39.26 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  45.65 
 
 		 986 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 2926 aa  71.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  45.65 
 
 		 995 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  48.45 
 
 		 1001 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.02 
 
 		 991 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1539  hypothetical protein  32.6 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  28.6 
 
 		 1068 aa  67.8  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.17 
 
 		 1881 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.51 
 
 		 1532 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  34.02 
 
 		 995 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  40.48 
 
 		 1004 aa  65.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 1782 aa  65.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  42.31 
 
 		 1099 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  39.33 
 
 		 1038 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  39.39 
 
 		 1033 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  47.31 
 
 		 1971 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  33 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  48.54 
 
 		 1177 aa  62.4  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  38.46 
 
 		 2407 aa  62  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.06 
 
 		 3506 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.54 
 
 		 3015 aa  61.2  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  36.96 
 
 		 2906 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  31.39 
 
 		 1113 aa  59.3  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  34.68 
 
 		 1741 aa  59.3  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.51 
 
 		 1369 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.36 
 
 		 2363 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.43 
 
 		 1108 aa  58.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  53.33 
 
 		 1055 aa  58.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.29 
 
 		 1227 aa  57.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  39.41 
 
 		 814 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  33.33 
 
 		 882 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  36.71 
 
 		 1861 aa  56.6  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  29.96 
 
 		 1011 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.89 
 
 		 1056 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  40.59 
 
 		 1130 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.6 
 
 		 1322 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2566  hypothetical protein  24.16 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.71 
 
 		 2578 aa  55.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.81 
 
 		 1285 aa  55.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  34.34 
 
 		 1571 aa  55.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.12 
 
 		 1011 aa  54.3  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 2371 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  41.91 
 
 		 861 aa  54.3  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  43.62 
 
 		 2711 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.93 
 
 		 1694 aa  53.5  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  38.82 
 
 		 1111 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  30.22 
 
 		 683 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  35.38 
 
 		 1006 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  32.1 
 
 		 2366 aa  52.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1835  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1845 aa  52  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 1550 aa  52  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.87 
 
 		 1053 aa  52  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.56 
 
 		 919 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  29.84 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  35.25 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  35.25 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  39.19 
 
 		 1459 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  31.68 
 
 		 2396 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1882 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 950 aa  49.7  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.63 
 
 		 3322 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.82 
 
 		 1357 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.12 
 
 		 634 aa  48.5  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  35.47 
 
 		 1446 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  28.53 
 
 		 2642 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  43.64 
 
 		 2365 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  43.64 
 
 		 2346 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  60.47 
 
 		 3629 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.31 
 
 		 906 aa  47.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  37.74 
 
 		 1129 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  37.74 
 
 		 1131 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  37.74 
 
 		 1131 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  37.74 
 
 		 1131 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>