156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2835 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.85 
 
 
4106 aa  1439    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.45 
 
 
2456 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.36 
 
 
3552 aa  2581    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  98.85 
 
 
3824 aa  7327    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  86.53 
 
 
3739 aa  5710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  34.46 
 
 
2625 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.41 
 
 
3325 aa  869    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  34.39 
 
 
3562 aa  952    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  76.74 
 
 
3721 aa  4907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  98.88 
 
 
3824 aa  7318    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.9 
 
 
2704 aa  1033    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.54 
 
 
5451 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  100 
 
 
3824 aa  7408    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  30.63 
 
 
8064 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  29.88 
 
 
3923 aa  627  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.11 
 
 
3516 aa  623  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.63 
 
 
6310 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  29.93 
 
 
4430 aa  537  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.32 
 
 
3204 aa  494  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.47 
 
 
4480 aa  473  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.28 
 
 
5561 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.28 
 
 
5561 aa  441  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.19 
 
 
5559 aa  430  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  27.16 
 
 
5559 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.17 
 
 
5561 aa  427  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  29.05 
 
 
2911 aa  391  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  31.3 
 
 
5080 aa  376  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.81 
 
 
2927 aa  326  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.42 
 
 
3314 aa  292  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.87 
 
 
4689 aa  287  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  26.8 
 
 
7149 aa  275  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  31.44 
 
 
6715 aa  271  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.73 
 
 
6683 aa  248  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 
6662 aa  248  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.97 
 
 
6779 aa  234  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.24 
 
 
4874 aa  228  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  37.79 
 
 
1278 aa  222  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  29.57 
 
 
1461 aa  185  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  35.33 
 
 
959 aa  134  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.4 
 
 
5171 aa  133  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.31 
 
 
3736 aa  132  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.66 
 
 
3734 aa  127  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.49 
 
 
3586 aa  126  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.04 
 
 
1586 aa  119  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  26.96 
 
 
4791 aa  118  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 
5839 aa  119  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.52 
 
 
5216 aa  109  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.02 
 
 
2402 aa  106  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.96 
 
 
739 aa  99  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 
1529 aa  98.2  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.57 
 
 
2839 aa  96.7  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  39.23 
 
 
635 aa  96.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.33 
 
 
5442 aa  90.9  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.7 
 
 
1096 aa  85.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 
4678 aa  84.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.63 
 
 
2768 aa  83.2  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  29.05 
 
 
1092 aa  81.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  26.09 
 
 
1424 aa  80.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  36.21 
 
 
747 aa  79.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.64 
 
 
1951 aa  77  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  27.11 
 
 
850 aa  76.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.21 
 
 
800 aa  76.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.19 
 
 
5745 aa  76.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  29.47 
 
 
1019 aa  75.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.63 
 
 
1695 aa  74.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  28.96 
 
 
1869 aa  74.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.09 
 
 
898 aa  72  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  26.61 
 
 
2193 aa  72.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  27.94 
 
 
4214 aa  72  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  30.81 
 
 
606 aa  72.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.21 
 
 
5743 aa  71.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  30.33 
 
 
4672 aa  70.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.75 
 
 
899 aa  70.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.79 
 
 
1219 aa  70.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  32.48 
 
 
747 aa  70.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  25.94 
 
 
2552 aa  68.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  27.62 
 
 
1428 aa  68.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.6 
 
 
2715 aa  68.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.66 
 
 
3477 aa  66.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  31.67 
 
 
499 aa  65.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  29.28 
 
 
714 aa  64.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  28.8 
 
 
549 aa  63.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  28.07 
 
 
913 aa  63.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  32.46 
 
 
1792 aa  63.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  29.34 
 
 
916 aa  62  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  30.94 
 
 
670 aa  62.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  30.71 
 
 
823 aa  61.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.56 
 
 
4836 aa  60.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  28.92 
 
 
888 aa  61.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.07 
 
 
376 aa  60.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  28.08 
 
 
500 aa  60.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  24.48 
 
 
744 aa  60.5  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.52 
 
 
16322 aa  60.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 
361 aa  60.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  28.5 
 
 
352 aa  59.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  31.4 
 
 
562 aa  59.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.16 
 
 
1597 aa  58.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  41.46 
 
 
3714 aa  58.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.74 
 
 
1332 aa  58.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  39.09 
 
 
1061 aa  58.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>