38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3383 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  100 
 
 
888 aa  1691    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.91 
 
 
2456 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  32.2 
 
 
2625 aa  101  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.79 
 
 
5561 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.79 
 
 
5561 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.82 
 
 
2927 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.45 
 
 
5559 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.45 
 
 
5561 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.45 
 
 
5559 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  32.7 
 
 
3923 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.35 
 
 
4106 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.92 
 
 
3739 aa  72.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.3 
 
 
3721 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.05 
 
 
3824 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.61 
 
 
3325 aa  70.5  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.26 
 
 
3824 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.92 
 
 
3824 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.54 
 
 
3552 aa  67.8  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.42 
 
 
6310 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.41 
 
 
3204 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  27.11 
 
 
8064 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.7 
 
 
2704 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.19 
 
 
1278 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  33.87 
 
 
4430 aa  58.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.45 
 
 
2911 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5685  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 
471 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  27.99 
 
 
5451 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  28.33 
 
 
500 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.27 
 
 
800 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  35.66 
 
 
2573 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.09 
 
 
3562 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  34.86 
 
 
1168 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  41.94 
 
 
4672 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  27.88 
 
 
3230 aa  48.5  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  22.7 
 
 
5080 aa  48.1  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
1150 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 
951 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  33.72 
 
 
541 aa  44.3  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>