50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1285 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
376 aa  741    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  31.48 
 
 
747 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1912  hypothetical protein  28.67 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0466434  normal  0.0319715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.72 
 
 
3739 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.72 
 
 
3824 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.39 
 
 
3824 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.39 
 
 
3721 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.06 
 
 
3824 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  24.18 
 
 
3562 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1270  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.04 
 
 
550 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.77 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.36 
 
 
3325 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  25.5 
 
 
1278 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.66 
 
 
3552 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.18 
 
 
4106 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  22.16 
 
 
5561 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  22.16 
 
 
5561 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
191 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  22.35 
 
 
5559 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.05 
 
 
2704 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
507 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  21.23 
 
 
5559 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  21.23 
 
 
5561 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  38.81 
 
 
414 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  25.87 
 
 
3230 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  39.06 
 
 
203 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  42.55 
 
 
205 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
709 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.09 
 
 
2911 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.09 
 
 
3204 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  44.44 
 
 
674 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 
250 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 
590 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0284  hypothetical protein  20.86 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000141879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  38.3 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 
142 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.64 
 
 
800 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
1225 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 
259 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
123 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  51.02 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  36.92 
 
 
264 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  42.55 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  42.22 
 
 
604 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  42.22 
 
 
621 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  42.22 
 
 
631 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05460  hypothetical protein  34.88 
 
 
151 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.187566  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  42.22 
 
 
587 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>