74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01400 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  100 
 
 		 606 aa  1150    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  50.63 
 
 		 6779 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.64 
 
 		 6683 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  49.64 
 
 		 6662 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.29 
 
 		 5442 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  43.02 
 
 		 4791 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.58 
 
 		 5839 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  41.96 
 
 		 2768 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  39.81 
 
 		 4689 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 5171 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  47.73 
 
 		 7149 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  33.33 
 
 		 1461 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  39.95 
 
 		 16322 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  32.05 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  36.69 
 
 		 3562 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.93 
 
 		 3314 aa  93.6  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.76 
 
 		 3325 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3474 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  30.33 
 
 		 4874 aa  87  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  32.49 
 
 		 2911 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  32.49 
 
 		 3204 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  32.43 
 
 		 3721 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.65 
 
 		 2927 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  30.96 
 
 		 3739 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  31.17 
 
 		 3824 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.34 
 
 		 3824 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.33 
 
 		 4106 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  27.59 
 
 		 5080 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.36 
 
 		 5561 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.36 
 
 		 5559 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.17 
 
 		 5561 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.11 
 
 		 5559 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  32.16 
 
 		 5561 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.48 
 
 		 2456 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  30.67 
 
 		 3824 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2625 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  32.15 
 
 		 4214 aa  72  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  31.02 
 
 		 777 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.78 
 
 		 3552 aa  68.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  28.71 
 
 		 3333 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  30.12 
 
 		 1951 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  30.27 
 
 		 3516 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34.12 
 
 		 2042 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  30.36 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.98 
 
 		 1332 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1278 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 		 4678 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  31.56 
 
 		 1529 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.14 
 
 		 898 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  29.1 
 
 		 916 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  35.45 
 
 		 899 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  31.74 
 
 		 2528 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.85 
 
 		 1919 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.83 
 
 		 2704 aa  53.9  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  35.96 
 
 		 850 aa  53.9  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1804 aa  51.2  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.02 
 
 		 4357 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1869 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  29.87 
 
 		 1092 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4430 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  26.67 
 
 		 913 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  52.38 
 
 		 1806 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  25.9 
 
 		 959 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  52.38 
 
 		 1350 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.37 
 
 		 2117 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 1586 aa  47  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  32.79 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1792 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  28.05 
 
 		 1428 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  40.91 
 
 		 1787 aa  44.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  30.57 
 
 		 696 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  36.79 
 
 		 635 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1311  hypothetical protein  44.26 
 
 		 618 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0843987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1902 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>