16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1311 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1201    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0843987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  35.17 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  37.54 
 
 		 2202 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1806 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1350 aa  73.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.67 
 
 		 4854 aa  70.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 7233 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  38.71 
 
 		 1232 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.61 
 
 		 4876 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.08 
 
 		 5962 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 6006 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 		 2825 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  29.5 
 
 		 1166 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.19 
 
 		 8682 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.7 
 
 		 11716 aa  43.9  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  34.02 
 
 		 6753 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>