127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3420 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3420  cellulase  100 
 
 		 635 aa  1257    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  70.74 
 
 		 709 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  55.52 
 
 		 556 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  43.96 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  45.86 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  43.95 
 
 		 333 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  45.02 
 
 		 349 aa  257  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  44.69 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  43.04 
 
 		 347 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  42.53 
 
 		 336 aa  249  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  40.24 
 
 		 356 aa  243  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  39.94 
 
 		 356 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  42.53 
 
 		 340 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  38.28 
 
 		 363 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  41.53 
 
 		 326 aa  211  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  39.46 
 
 		 334 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  31.25 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.89 
 
 		 3325 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.86 
 
 		 4106 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.83 
 
 		 2927 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1278 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  40.33 
 
 		 3824 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  39.78 
 
 		 3824 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  39.78 
 
 		 3739 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  40.33 
 
 		 3721 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  39.23 
 
 		 3824 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.81 
 
 		 2704 aa  95.1  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  42.16 
 
 		 3562 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.91 
 
 		 3552 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 959 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 831 aa  87.4  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.04 
 
 		 5559 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  29.34 
 
 		 5561 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.83 
 
 		 5559 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.04 
 
 		 5561 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 814 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  34.89 
 
 		 2911 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.53 
 
 		 5561 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  37.67 
 
 		 3204 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.45 
 
 		 2839 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.1 
 
 		 5171 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  37.84 
 
 		 3586 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1529 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.49 
 
 		 5839 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  32.56 
 
 		 5080 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.93 
 
 		 3314 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  31.79 
 
 		 3516 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  39.31 
 
 		 2625 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  38.07 
 
 		 2456 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.52 
 
 		 3391 aa  61.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  28.76 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  27.12 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  30.21 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  24.56 
 
 		 312 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  31.03 
 
 		 399 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  31.52 
 
 		 747 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 390 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 332 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  26.37 
 
 		 1294 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  28.71 
 
 		 561 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  38.2 
 
 		 562 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 365 aa  53.9  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  32.75 
 
 		 1461 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  26.37 
 
 		 1414 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  27.1 
 
 		 869 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 461 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  27.22 
 
 		 1369 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 		 7149 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1792 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1207 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 6683 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  34.09 
 
 		 717 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  31.68 
 
 		 3925 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  32.45 
 
 		 4672 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.03 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  35.68 
 
 		 4689 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 6662 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.89 
 
 		 2768 aa  51.6  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.08 
 
 		 6779 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 847 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  26.05 
 
 		 400 aa  51.2  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.21 
 
 		 900 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 4678 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.25 
 
 		 863 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.2 
 
 		 2305 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  35.37 
 
 		 739 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  29.45 
 
 		 4874 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.04 
 
 		 365 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.26 
 
 		 5442 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.73 
 
 		 4480 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.27 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 4748 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 468 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  30.77 
 
 		 850 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 1586 aa  48.9  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  20.26 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>