59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1799 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1123    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.86 
 
 		 3562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.09 
 
 		 2927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.13 
 
 		 3227 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.27 
 
 		 3699 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 3699 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  40.62 
 
 		 2503 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  37.66 
 
 		 3089 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.18 
 
 		 3544 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.54 
 
 		 1359 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  33.2 
 
 		 2886 aa  75.1  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  42.55 
 
 		 2194 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  32.22 
 
 		 3739 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.16 
 
 		 4106 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  32.22 
 
 		 3824 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  39.22 
 
 		 3721 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1061 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  36.36 
 
 		 635 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.6 
 
 		 3314 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 		 2704 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  37.25 
 
 		 3824 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.67 
 
 		 3824 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.21 
 
 		 3552 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  34.45 
 
 		 3325 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  32.03 
 
 		 1428 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  24.05 
 
 		 2715 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  33.85 
 
 		 2192 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3204 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  33.33 
 
 		 2911 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1452 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  34.39 
 
 		 3089 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  34.39 
 
 		 499 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  26.77 
 
 		 2768 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  30.97 
 
 		 1424 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1902 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  36.59 
 
 		 4672 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.4 
 
 		 5561 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25 
 
 		 5561 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2233 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  26.97 
 
 		 5442 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  33.78 
 
 		 5561 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  33.78 
 
 		 5559 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  39.78 
 
 		 2042 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  31.33 
 
 		 3586 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  35.14 
 
 		 5559 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  31.39 
 
 		 747 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  44.26 
 
 		 1848 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1278 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.75 
 
 		 2802 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1869 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  31.82 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  28.95 
 
 		 887 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.93 
 
 		 852 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.61 
 
 		 2207 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.73 
 
 		 1096 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  29.29 
 
 		 1461 aa  44.3  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  39.29 
 
 		 5080 aa  43.9  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 		 3066 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>