30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1448 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  100 
 
 
1019 aa  1934    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  31.14 
 
 
2625 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  27.59 
 
 
6310 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  27.84 
 
 
3923 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  27.69 
 
 
8064 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  31.51 
 
 
2456 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 
2704 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.47 
 
 
5451 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.31 
 
 
3552 aa  108  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.78 
 
 
2927 aa  97.8  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.34 
 
 
3562 aa  97.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.62 
 
 
3824 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.45 
 
 
3721 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.45 
 
 
3824 aa  88.6  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.35 
 
 
3824 aa  88.6  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.83 
 
 
3314 aa  84.7  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.47 
 
 
3739 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.11 
 
 
4106 aa  79.7  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.66 
 
 
3325 aa  71.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  31.96 
 
 
1278 aa  58.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  46.84 
 
 
4430 aa  54.7  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  37.93 
 
 
2402 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  27.06 
 
 
5080 aa  51.2  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  48.21 
 
 
906 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  37.27 
 
 
539 aa  49.3  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  29.38 
 
 
1207 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  35.79 
 
 
4672 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  30.63 
 
 
3586 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  25.89 
 
 
500 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1196  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.21 
 
 
3173 aa  45.8  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>