111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6475 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  46.83 
 
 
166 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4814  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  38.52 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 
1072 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.41 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.8 
 
 
806 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.8 
 
 
806 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  39.77 
 
 
547 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  36.96 
 
 
890 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.31 
 
 
446 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  32.45 
 
 
803 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.75 
 
 
479 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.46 
 
 
489 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  37.78 
 
 
490 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.89 
 
 
472 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.79 
 
 
516 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  31.62 
 
 
1577 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.3 
 
 
801 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.01 
 
 
476 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.88 
 
 
603 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  34.53 
 
 
801 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  35.14 
 
 
492 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  28.25 
 
 
427 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  32.81 
 
 
489 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  30.94 
 
 
494 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.5 
 
 
933 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.85 
 
 
548 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.56 
 
 
498 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.37 
 
 
493 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  32.33 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.54 
 
 
1128 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  32.59 
 
 
461 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  29.56 
 
 
642 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.04 
 
 
507 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.17 
 
 
1100 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  34.65 
 
 
373 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
423 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  34.13 
 
 
806 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33.33 
 
 
492 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  30.77 
 
 
644 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.66 
 
 
794 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  37.37 
 
 
468 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.92 
 
 
426 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  40.96 
 
 
732 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  38.55 
 
 
452 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  31.54 
 
 
380 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.13 
 
 
497 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  39.24 
 
 
801 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.33 
 
 
493 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  26.88 
 
 
482 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  33.64 
 
 
374 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.38 
 
 
627 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  36.14 
 
 
417 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  35.04 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  29.85 
 
 
436 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  30.66 
 
 
451 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  37.66 
 
 
469 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  37.63 
 
 
468 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  32.29 
 
 
653 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.81 
 
 
522 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  36.14 
 
 
384 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  32.63 
 
 
1016 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  37.14 
 
 
1207 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  36.14 
 
 
634 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  36.71 
 
 
535 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.12 
 
 
497 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  25.93 
 
 
240 aa  47.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.72 
 
 
672 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  39.74 
 
 
358 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.36 
 
 
368 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  30.14 
 
 
401 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  30.47 
 
 
488 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  25.28 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 
391 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  26.43 
 
 
503 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  28.12 
 
 
414 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.37 
 
 
558 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  38.64 
 
 
491 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.5 
 
 
647 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.23 
 
 
496 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  26.81 
 
 
430 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  29.79 
 
 
567 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  28.89 
 
 
465 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.43 
 
 
943 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.15 
 
 
663 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  26.32 
 
 
618 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 
709 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  26.45 
 
 
487 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
571 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.78 
 
 
566 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  34.57 
 
 
589 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  28.86 
 
 
569 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  28.89 
 
 
571 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  30.3 
 
 
748 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.75 
 
 
580 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>