19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1839 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  46.46 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3370  hypothetical protein  42.31 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.0308519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3372  hypothetical protein  44.07 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4280  hypothetical protein  31.52 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000396864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  32.4 
 
 		 2311 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  24.32 
 
 		 460 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.11 
 
 		 2105 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  24.77 
 
 		 653 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  28.48 
 
 		 801 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1362 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.3 
 
 		 2668 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  26.47 
 
 		 801 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.53 
 
 		 1655 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  27.56 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  28.36 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.41 
 
 		 824 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0112  hypothetical protein  24.16 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.35811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>