94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1748 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  100 
 
 		 1347 aa  2597    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  44.27 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40.8 
 
 		 436 aa  77.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.53 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.88 
 
 		 1413 aa  68.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  41.54 
 
 		 647 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  39.06 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 		 982 aa  65.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.8 
 
 		 491 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.2 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  38.89 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.85 
 
 		 476 aa  62  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  40 
 
 		 566 aa  62  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  38.76 
 
 		 737 aa  62  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 468 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  38.98 
 
 		 672 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 1139 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  38.28 
 
 		 503 aa  60.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.3 
 
 		 495 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.38 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.71 
 
 		 2073 aa  58.9  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 1577 aa  58.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  44.16 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  37.3 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  47.89 
 
 		 863 aa  58.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.4 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.59 
 
 		 794 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  44.57 
 
 		 1016 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  44.94 
 
 		 943 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  41.56 
 
 		 240 aa  58.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 571 aa  58.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.8 
 
 		 492 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 474 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.33 
 
 		 507 aa  57.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.22 
 
 		 801 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 		 858 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 		 858 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 483 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  36.84 
 
 		 858 aa  56.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  36.84 
 
 		 805 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  36.84 
 
 		 807 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  39.82 
 
 		 806 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  36.84 
 
 		 800 aa  55.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  36.84 
 
 		 800 aa  55.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.31 
 
 		 510 aa  55.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  36 
 
 		 548 aa  55.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.2 
 
 		 497 aa  55.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.38 
 
 		 520 aa  55.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.58 
 
 		 493 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.56 
 
 		 691 aa  55.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  35.94 
 
 		 824 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 498 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  35.43 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 1049 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  32.81 
 
 		 560 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  36.36 
 
 		 411 aa  53.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.85 
 
 		 487 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.38 
 
 		 489 aa  53.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.66 
 
 		 537 aa  52.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.43 
 
 		 392 aa  52.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.8 
 
 		 500 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.58 
 
 		 507 aa  51.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 374 aa  50.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.55 
 
 		 555 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.8 
 
 		 466 aa  49.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  36 
 
 		 801 aa  49.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  42.86 
 
 		 840 aa  49.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.78 
 
 		 695 aa  48.9  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.42 
 
 		 756 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.03 
 
 		 1567 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  38.05 
 
 		 916 aa  47.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.05 
 
 		 815 aa  48.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.07 
 
 		 472 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  37.07 
 
 		 908 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  35.2 
 
 		 469 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.86 
 
 		 663 aa  47.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  40.8 
 
 		 453 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  35.09 
 
 		 574 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  36.97 
 
 		 748 aa  47.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 547 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.23 
 
 		 503 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.51 
 
 		 1888 aa  46.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  40.7 
 
 		 576 aa  46.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.85 
 
 		 535 aa  45.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>