149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1075 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  65.42 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.81 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.39 
 
 		 436 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.38 
 
 		 691 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  41.18 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.77 
 
 		 1016 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  36.54 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.01 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.61 
 
 		 618 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  40.45 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  48.48 
 
 		 488 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31.3 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  48.48 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.23 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.81 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.05 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  29.85 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  32.7 
 
 		 1222 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.19 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  39.76 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  35.16 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.53 
 
 		 806 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  29.78 
 
 		 1139 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.5 
 
 		 1567 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.39 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  29.58 
 
 		 569 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  31.68 
 
 		 957 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 634 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.77 
 
 		 1072 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  30.69 
 
 		 884 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.92 
 
 		 824 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.23 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.18 
 
 		 982 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 1347 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  29.29 
 
 		 571 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.77 
 
 		 466 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  28.28 
 
 		 1259 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  26.81 
 
 		 566 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  34.35 
 
 		 497 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.25 
 
 		 627 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.14 
 
 		 756 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.94 
 
 		 493 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  25.76 
 
 		 468 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 		 863 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 494 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 560 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.63 
 
 		 503 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.86 
 
 		 647 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 368 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 732 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 603 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 469 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  41.25 
 
 		 446 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.82 
 
 		 943 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.67 
 
 		 493 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  35.16 
 
 		 468 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.67 
 
 		 498 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  25.95 
 
 		 380 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  28.97 
 
 		 576 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  33.66 
 
 		 615 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  24.49 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.8 
 
 		 426 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.34 
 
 		 461 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  27.54 
 
 		 644 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 		 858 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 858 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 858 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.21 
 
 		 507 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  32.73 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 489 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.73 
 
 		 489 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.23 
 
 		 558 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  31.48 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  28.68 
 
 		 451 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 		 805 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  30.07 
 
 		 807 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 		 933 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.78 
 
 		 503 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 		 800 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  30.07 
 
 		 800 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  32.56 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  41.67 
 
 		 726 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  31.33 
 
 		 801 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  27.42 
 
 		 664 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  26.57 
 
 		 425 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.07 
 
 		 430 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.34 
 
 		 411 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.52 
 
 		 495 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  32.85 
 
 		 497 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  37.35 
 
 		 653 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  26.67 
 
 		 445 aa  48.9  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>