59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1301 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  100 
 
 		 345 aa  724    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  43.4 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  39.83 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  41.03 
 
 		 666 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  41.38 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  40 
 
 		 571 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  39.53 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  39.77 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.83 
 
 		 567 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  40.12 
 
 		 644 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  38.07 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  38.79 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  36.97 
 
 		 560 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  33.24 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  32.98 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  32.98 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  33.97 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  36.7 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  32.35 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  31.8 
 
 		 746 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.95 
 
 		 686 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.78 
 
 		 730 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  30.55 
 
 		 627 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  30.14 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  30.14 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  30.14 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  32.83 
 
 		 457 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  28.18 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.29 
 
 		 865 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.41 
 
 		 794 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.99 
 
 		 487 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  30.15 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  31.54 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  30.88 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  27.53 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  24.84 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  31.82 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  25.94 
 
 		 1081 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  28.57 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  30.21 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  28.02 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  22.99 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  28.4 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07966  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488758  normal  0.390044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  25.71 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  25.71 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  26.97 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31869  predicted protein  26.4 
 
 		 530 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.736523  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  21.83 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  25.81 
 
 		 427 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>