64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2469 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  100 
 
 		 746 aa  1507    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  40.05 
 
 		 368 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  39.39 
 
 		 368 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4265  hypothetical protein  36.86 
 
 		 430 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  39.35 
 
 		 366 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  37.64 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  38.14 
 
 		 457 aa  214  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  37.23 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  37.23 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  37.23 
 
 		 361 aa  210  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  36.17 
 
 		 567 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  37.36 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  35.24 
 
 		 865 aa  200  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2943  hypothetical protein  31.25 
 
 		 378 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6826  hypothetical protein  32.32 
 
 		 379 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  33.13 
 
 		 560 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4187  hypothetical protein  30.9 
 
 		 389 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  33.83 
 
 		 322 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  34.12 
 
 		 391 aa  167  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  34.64 
 
 		 326 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  35.31 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  31.49 
 
 		 345 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  31.79 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  34.25 
 
 		 389 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  33.24 
 
 		 338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  33.53 
 
 		 644 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  32.89 
 
 		 744 aa  150  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  32.25 
 
 		 345 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  33.63 
 
 		 627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  32.05 
 
 		 326 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  33.14 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  30.49 
 
 		 666 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  33.24 
 
 		 347 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  32.06 
 
 		 376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  32.28 
 
 		 730 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.17 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  29.38 
 
 		 334 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.83 
 
 		 487 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  28.19 
 
 		 325 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  29.82 
 
 		 393 aa  95.5  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  25.11 
 
 		 827 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  28.74 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1281  hypothetical protein  24.31 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000210096  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4229  hypothetical protein  21.22 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  25.91 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  27.17 
 
 		 434 aa  60.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  30.2 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  24.64 
 
 		 400 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  25.96 
 
 		 400 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  22.1 
 
 		 1081 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  24.39 
 
 		 427 aa  47.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  23.72 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  24.52 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  23.72 
 
 		 427 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  23.72 
 
 		 427 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  23.72 
 
 		 427 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>