53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2890 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  99.77 
 
 
427 aa  875    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  99.06 
 
 
427 aa  869    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  86.89 
 
 
427 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  86.89 
 
 
427 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  86.89 
 
 
427 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  86.89 
 
 
427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  86.89 
 
 
427 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  99.77 
 
 
427 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  98.83 
 
 
427 aa  868    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  100 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  99.77 
 
 
427 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  99.77 
 
 
427 aa  875    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  100 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  79.16 
 
 
427 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  47.25 
 
 
434 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  47 
 
 
400 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  46.27 
 
 
400 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  30.62 
 
 
439 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  30.96 
 
 
393 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.88 
 
 
794 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.24 
 
 
487 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  31.36 
 
 
686 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  28.53 
 
 
627 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  28.57 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  29.51 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  27.73 
 
 
730 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.62 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  25.86 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  28.91 
 
 
567 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  27.27 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  27.15 
 
 
326 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  24.6 
 
 
571 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  30.5 
 
 
345 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  25.32 
 
 
326 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  24.51 
 
 
389 aa  56.6  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  26.39 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  26.17 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  28.23 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  24.55 
 
 
560 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  27.27 
 
 
666 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  26.79 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  31.48 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  26.97 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.85 
 
 
865 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  25.66 
 
 
322 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  27.54 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  25.97 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  24.52 
 
 
746 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  29.41 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  27.01 
 
 
361 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  27.01 
 
 
361 aa  43.9  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  27.01 
 
 
361 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>