53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0795 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  99.06 
 
 		 427 aa  870    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  98.83 
 
 		 427 aa  868    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  98.83 
 
 		 427 aa  869    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  87.82 
 
 		 427 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  99.06 
 
 		 427 aa  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  100 
 
 		 427 aa  876    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  98.83 
 
 		 427 aa  868    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  99.06 
 
 		 427 aa  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  99.06 
 
 		 427 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  98.83 
 
 		 427 aa  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  79.39 
 
 		 427 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  47.25 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  47 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  46 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  31.11 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  31.7 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.88 
 
 		 794 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.24 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  31.71 
 
 		 686 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  28.53 
 
 		 627 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  29.37 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  28.57 
 
 		 347 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  27.45 
 
 		 730 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.97 
 
 		 644 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  25.86 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  29.3 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  27.27 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  24.44 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  27.49 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  24.78 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  25.79 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  31.16 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  26.49 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  24.51 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  28.23 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  26.17 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  27.27 
 
 		 666 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  28.57 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  31.48 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  25.71 
 
 		 345 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  28.85 
 
 		 865 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  27.4 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  25.97 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  27.74 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  27.74 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  25 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  24.52 
 
 		 746 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  29.41 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  27.74 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>