60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1984 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  98.15 
 
 		 378 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 378 aa  787    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  94.69 
 
 		 377 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.78 
 
 		 392 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  72.95 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  52.43 
 
 		 580 aa  358  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.73 
 
 		 648 aa  352  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  54.19 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.92 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.61 
 
 		 315 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.84 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.98 
 
 		 315 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.62 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.48 
 
 		 505 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.86 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.43 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.23 
 
 		 316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  47.44 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  46.01 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.4 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  44.83 
 
 		 340 aa  288  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  44.87 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.26 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.49 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.33 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  33.22 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.08 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.55 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.96 
 
 		 507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.46 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 628 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.45 
 
 		 2073 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 634 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 634 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 634 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  31.69 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 627 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  30.05 
 
 		 502 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  30.57 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 517 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.63 
 
 		 1278 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  25.14 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.22 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.14 
 
 		 713 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.53 
 
 		 495 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  22.5 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 512 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  20.44 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>