79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2237 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 349 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  64.84 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.71 
 
 		 350 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.24 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.95 
 
 		 507 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.7 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.82 
 
 		 347 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.94 
 
 		 607 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.91 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.65 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  35.19 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  35.93 
 
 		 627 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.1 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 634 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  34.47 
 
 		 634 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 634 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  33.43 
 
 		 502 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 		 580 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.73 
 
 		 628 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.36 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.54 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.23 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.54 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.43 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.54 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.92 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  33.23 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.38 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  32.72 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.84 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.99 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.75 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 648 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.29 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.6 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.91 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.01 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.69 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.38 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.53 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.8 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.35 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.35 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.56 
 
 		 2073 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 1278 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.53 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 495 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.5 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.49 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.01 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.56 
 
 		 535 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  22.29 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  21.82 
 
 		 713 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 		 524 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 644 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  23.08 
 
 		 537 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.31 
 
 		 472 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  22.33 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  21.48 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  21.83 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 537 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  21.79 
 
 		 522 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  22.96 
 
 		 699 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  22.87 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.03 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.84 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>