163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3811 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 535 aa  1113    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  96.82 
 
 		 540 aa  1082    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  65.74 
 
 		 545 aa  738    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  53.16 
 
 		 537 aa  588  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  53.27 
 
 		 534 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  54.13 
 
 		 537 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  49.61 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  50 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  54.33 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 		 636 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  30.75 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 563 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.57 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.94 
 
 		 519 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  27.54 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.74 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.54 
 
 		 546 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.15 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.04 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.81 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  30.07 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 498 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.49 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  32.2 
 
 		 497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.94 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.94 
 
 		 566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.22 
 
 		 541 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  31.61 
 
 		 532 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.64 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 572 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 560 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.26 
 
 		 488 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.5 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 1195 aa  123  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.46 
 
 		 562 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  28.77 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.83 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.77 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.73 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.78 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  29.18 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  30.12 
 
 		 542 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.66 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.86 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.61 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.34 
 
 		 559 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.27 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.48 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  23.96 
 
 		 556 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  23.43 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.22 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.32 
 
 		 1474 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.17 
 
 		 525 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  25.85 
 
 		 546 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.02 
 
 		 746 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.05 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  24.61 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.63 
 
 		 1338 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  26.04 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  34.42 
 
 		 665 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  23.41 
 
 		 590 aa  74.7  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  26.32 
 
 		 901 aa  73.9  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 699 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.34 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.11 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  23.82 
 
 		 1585 aa  67.4  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.4 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.89 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  22.31 
 
 		 829 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>