132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0660 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
773 aa  1603    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  45.18 
 
 
1139 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  43.66 
 
 
1067 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  43.89 
 
 
971 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  42.36 
 
 
758 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  41.65 
 
 
931 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  39.78 
 
 
1010 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  32.31 
 
 
1238 aa  309  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.63 
 
 
1139 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  31.09 
 
 
699 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  29.65 
 
 
704 aa  195  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  26.85 
 
 
638 aa  150  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  27.71 
 
 
729 aa  144  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  34.05 
 
 
969 aa  124  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.644497 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  29.52 
 
 
907 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  30.06 
 
 
1208 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  28.93 
 
 
755 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  26.74 
 
 
1058 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.24 
 
 
842 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  66.67 
 
 
707 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  58.73 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  55.07 
 
 
484 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  53.03 
 
 
649 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  50.68 
 
 
415 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  45.83 
 
 
567 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  27.95 
 
 
918 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  63.33 
 
 
789 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 
951 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
490 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  50.75 
 
 
571 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  35 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 
814 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.05 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  64.41 
 
 
630 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 
1224 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 
736 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.06 
 
 
790 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  66.1 
 
 
922 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  48.53 
 
 
611 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.62 
 
 
710 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  57.14 
 
 
600 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  55.93 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.84 
 
 
469 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  48.05 
 
 
554 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  55.38 
 
 
563 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 
895 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.14 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  54.84 
 
 
961 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.85 
 
 
582 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  54.24 
 
 
501 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.44 
 
 
831 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  43.08 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  60.34 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  50.79 
 
 
948 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 
928 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 
1077 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  48.65 
 
 
679 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 
928 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
311 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 
524 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  55.17 
 
 
820 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  56.45 
 
 
639 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  42.68 
 
 
739 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 
660 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  47.14 
 
 
965 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  54.1 
 
 
710 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
580 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
566 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.43 
 
 
350 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  45.95 
 
 
558 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.62 
 
 
535 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  45.83 
 
 
707 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  51.61 
 
 
982 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  38.82 
 
 
900 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  38.57 
 
 
423 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.23 
 
 
533 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.15 
 
 
1051 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.72 
 
 
537 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
742 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  43.08 
 
 
477 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  41.79 
 
 
425 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.46 
 
 
511 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  35.29 
 
 
471 aa  57.4  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  46.77 
 
 
1601 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  41.38 
 
 
532 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.12 
 
 
1209 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  40.3 
 
 
833 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  42.37 
 
 
757 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  30.97 
 
 
552 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.62 
 
 
807 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 
683 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  45 
 
 
870 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  39.06 
 
 
737 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>