136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0729 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  100 
 
 		 537 aa  1066    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  31.21 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  37.18 
 
 		 742 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  34 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  42.61 
 
 		 654 aa  154  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  27.15 
 
 		 616 aa  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  36.68 
 
 		 676 aa  150  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  33.82 
 
 		 617 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  30.79 
 
 		 628 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  29.91 
 
 		 594 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  30.33 
 
 		 644 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  27.13 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  32.57 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  28.89 
 
 		 579 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  36.94 
 
 		 762 aa  114  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  35.29 
 
 		 286 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.52 
 
 		 710 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  39.09 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  23.46 
 
 		 644 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  55.13 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 683 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.33 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  56.96 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  58.97 
 
 		 630 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  60 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  54.69 
 
 		 1224 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  38.89 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.46 
 
 		 1051 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  59.72 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 		 895 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  57.81 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  56.72 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  55.26 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  57.97 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.52 
 
 		 1601 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  41.98 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.42 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  62.32 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  55.22 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  56.25 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  55.71 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  57.35 
 
 		 928 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  49.37 
 
 		 814 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.35 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  55.22 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  42.53 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.84 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  58.21 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.67 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.3 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  55.56 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  56.45 
 
 		 928 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  56.06 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  34.17 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  44.9 
 
 		 922 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  47.62 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  54.84 
 
 		 965 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 		 660 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  46.84 
 
 		 837 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  53.12 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  41.86 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.76 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  48.48 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.66 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.59 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 590 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.14 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  30.26 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  47.69 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  54.69 
 
 		 961 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  46.77 
 
 		 948 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  44 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  43.94 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  41.79 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  51.72 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 780 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  51.95 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  46.77 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  43.94 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  38.81 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  40.23 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  50.77 
 
 		 1122 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  43.94 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  41.43 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  39.13 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  45.16 
 
 		 746 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 		 334 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 739 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.86 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 471 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  44.44 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  51.79 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  42.25 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>