42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3130 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 632 aa  1286    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  41.98 
 
 		 803 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  37.39 
 
 		 665 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  36.29 
 
 		 739 aa  346  8e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 1601 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.69 
 
 		 833 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.01 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  26.41 
 
 		 591 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  28.23 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  25.37 
 
 		 571 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  31.32 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.39 
 
 		 646 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 649 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.81 
 
 		 900 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  27.78 
 
 		 864 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  25.65 
 
 		 854 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.19 
 
 		 867 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 895 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  26.24 
 
 		 578 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  28.14 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  31.87 
 
 		 875 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  33.08 
 
 		 906 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  24.39 
 
 		 885 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 1224 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.19 
 
 		 874 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  32.42 
 
 		 1076 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.33 
 
 		 998 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  25.22 
 
 		 1100 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  27.12 
 
 		 537 aa  94.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.99 
 
 		 927 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 812 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.32 
 
 		 786 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  28.03 
 
 		 815 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.41 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  26.62 
 
 		 851 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  24.84 
 
 		 1105 aa  70.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  26.71 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.75 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24 
 
 		 2042 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.25 
 
 		 985 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  29.84 
 
 		 837 aa  47.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  25.2 
 
 		 1452 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>