201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3021 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  100 
 
 		 722 aa  1470    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  61.08 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 1184 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 1028 aa  134  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  49.59 
 
 		 879 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.03 
 
 		 409 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.11 
 
 		 1564 aa  114  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.71 
 
 		 884 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.87 
 
 		 383 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  29.41 
 
 		 883 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  30.06 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 752 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.28 
 
 		 1290 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 289 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.26 
 
 		 252 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.81 
 
 		 912 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  32.02 
 
 		 423 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  33.07 
 
 		 291 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  31.4 
 
 		 281 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 346 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 1321 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 694 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.68 
 
 		 633 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.07 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 		 279 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.24 
 
 		 532 aa  96.3  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  34.25 
 
 		 274 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.53 
 
 		 358 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.15 
 
 		 637 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.06 
 
 		 819 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  31.72 
 
 		 286 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.74 
 
 		 547 aa  89  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.82 
 
 		 276 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  31.84 
 
 		 1028 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  30.73 
 
 		 1918 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3726  glycosy hydrolase family protein  28.46 
 
 		 287 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.29 
 
 		 1139 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.15 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  31.02 
 
 		 999 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.09 
 
 		 742 aa  84.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.64 
 
 		 755 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  27.24 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 291 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  29.06 
 
 		 1441 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.61 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.34 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  32.91 
 
 		 850 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  30.04 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  25.08 
 
 		 328 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  34.93 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  31.84 
 
 		 732 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  35.83 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  33.56 
 
 		 1070 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.7 
 
 		 1158 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.81 
 
 		 756 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.85 
 
 		 1007 aa  77.4  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.41 
 
 		 315 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.1 
 
 		 722 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.17 
 
 		 962 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.9 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.04 
 
 		 929 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.78 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.46 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.02 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.4 
 
 		 1059 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.63 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  34.27 
 
 		 1103 aa  74.3  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  27.5 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  33.85 
 
 		 1581 aa  73.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.84 
 
 		 815 aa  73.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.11 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.57 
 
 		 282 aa  73.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.96 
 
 		 261 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.3 
 
 		 290 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.21 
 
 		 940 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.13 
 
 		 987 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  27.62 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.92 
 
 		 1321 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 953 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.93 
 
 		 915 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.5 
 
 		 1694 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  39.13 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.48 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  31.75 
 
 		 4013 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.89 
 
 		 627 aa  71.2  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.76 
 
 		 581 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 1332 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  25.38 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>