123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0729 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54.32 
 
 
984 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  55.21 
 
 
1121 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.86 
 
 
938 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  57.01 
 
 
973 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  64.24 
 
 
1478 aa  867    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  55.76 
 
 
900 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  64.24 
 
 
1759 aa  865    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  57.71 
 
 
785 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  56.91 
 
 
741 aa  808    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  55.43 
 
 
974 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  57.1 
 
 
842 aa  726    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  64.24 
 
 
1904 aa  863    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  51.93 
 
 
894 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  54.52 
 
 
854 aa  702    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  54.37 
 
 
966 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  56.11 
 
 
963 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  58.31 
 
 
854 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.6 
 
 
919 aa  918    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 
722 aa  1494    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.25 
 
 
979 aa  749    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  58.33 
 
 
737 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  46.51 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  61.67 
 
 
885 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  50.85 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  57.41 
 
 
526 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  57.63 
 
 
725 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  58.18 
 
 
536 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  52.46 
 
 
780 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  51.67 
 
 
532 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  43.04 
 
 
621 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  46.77 
 
 
477 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  54.55 
 
 
757 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  33.06 
 
 
295 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  54.39 
 
 
552 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 
477 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.26 
 
 
895 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  55.17 
 
 
833 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  52.73 
 
 
462 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  50 
 
 
460 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  51.72 
 
 
604 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  50.85 
 
 
715 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  46.38 
 
 
861 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  44.62 
 
 
955 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  54.39 
 
 
949 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  52.63 
 
 
435 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  54.55 
 
 
874 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  54.1 
 
 
951 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  52.73 
 
 
1122 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.44 
 
 
539 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  44.26 
 
 
436 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 
524 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 
509 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  52.63 
 
 
686 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  57.41 
 
 
308 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  45.16 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  42.25 
 
 
848 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  39.56 
 
 
391 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  46.03 
 
 
873 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  43.86 
 
 
746 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 
541 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  51.61 
 
 
490 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  33.61 
 
 
303 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.18 
 
 
469 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  61.36 
 
 
676 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 
683 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  39.44 
 
 
298 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  44.29 
 
 
560 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  43.08 
 
 
577 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.67 
 
 
537 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
1224 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  35.53 
 
 
423 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  41.18 
 
 
965 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  39.71 
 
 
535 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 
1015 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  38.37 
 
 
482 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.81 
 
 
842 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  45.9 
 
 
646 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.86 
 
 
600 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 
580 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.73 
 
 
707 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  42.42 
 
 
778 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.64 
 
 
528 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
1077 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.13 
 
 
900 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.37 
 
 
948 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 
475 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.33 
 
 
710 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  37.88 
 
 
928 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  40.32 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 
591 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.59 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
789 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 
563 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 
619 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  43.86 
 
 
501 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 
611 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
1601 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
484 aa  48.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  39.66 
 
 
583 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.66 
 
 
982 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>