48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1090 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  100 
 
 
771 aa  1588    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0240  hypothetical protein  66.25 
 
 
649 aa  832    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9524  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1089  hypothetical protein  49.06 
 
 
603 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1220  hypothetical protein  43.13 
 
 
612 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222841  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  96.76 
 
 
895 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0309  hypothetical protein  30.83 
 
 
526 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0778  hypothetical protein  40.65 
 
 
330 aa  107  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622138  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2163  hypothetical protein  38.75 
 
 
335 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  33.06 
 
 
1096 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.73 
 
 
1047 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  31.58 
 
 
499 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  32.8 
 
 
827 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  35.15 
 
 
1219 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  31.77 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.66 
 
 
587 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 
899 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  28.93 
 
 
606 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.7 
 
 
1141 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
626 aa  62  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.43 
 
 
1332 aa  62  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  32.04 
 
 
675 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2398  hypothetical protein  38.83 
 
 
423 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  27.83 
 
 
1804 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  29.5 
 
 
606 aa  60.1  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.72 
 
 
2042 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  30.51 
 
 
916 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5730  hypothetical protein  44.44 
 
 
615 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199114  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  28.34 
 
 
343 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0784  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  53.5  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.55 
 
 
612 aa  52  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  38.55 
 
 
480 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  32.64 
 
 
3925 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  29.46 
 
 
491 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  30.32 
 
 
549 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.59 
 
 
1951 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  26.03 
 
 
777 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  27.27 
 
 
1369 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  35.46 
 
 
1585 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.91 
 
 
3586 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  36.11 
 
 
913 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.43 
 
 
1887 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  27.23 
 
 
1554 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  26.94 
 
 
1902 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  25.82 
 
 
1457 aa  45.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.25 
 
 
2117 aa  44.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.21 
 
 
3822 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>