17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0240 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  66.25 
 
 
771 aa  819    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0240  hypothetical protein  100 
 
 
649 aa  1342    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9524  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1089  hypothetical protein  49.92 
 
 
603 aa  555  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1220  hypothetical protein  42.7 
 
 
612 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222841  normal  0.774718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0309  hypothetical protein  34.56 
 
 
526 aa  180  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0778  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  117  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622138  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2163  hypothetical protein  44.19 
 
 
335 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  50.54 
 
 
895 aa  97.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2398  hypothetical protein  34.56 
 
 
423 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5730  hypothetical protein  29.19 
 
 
615 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199114  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  39.81 
 
 
675 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  31.76 
 
 
480 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.76 
 
 
1047 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  33.68 
 
 
1096 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.04 
 
 
1031 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
827 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.97 
 
 
491 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>