71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2890 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.02 
 
 		 1035 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  47.93 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  52.29 
 
 		 409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  36.28 
 
 		 1310 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  36.51 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  36.36 
 
 		 608 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  36.78 
 
 		 2117 aa  90.5  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  37.28 
 
 		 845 aa  90.1  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  28.22 
 
 		 2002 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  41.25 
 
 		 253 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  41.1 
 
 		 670 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  37.5 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  36.3 
 
 		 1222 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  33.58 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  38.03 
 
 		 1081 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  38.03 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.73 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  36.26 
 
 		 841 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  35.21 
 
 		 940 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  31.98 
 
 		 835 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.17 
 
 		 1095 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.51 
 
 		 4357 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  35.66 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  32.58 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  38.06 
 
 		 316 aa  67  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  28.73 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 2082 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  32.58 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  39.52 
 
 		 1736 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 		 1323 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1076 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  30.59 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.17 
 
 		 746 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  32.4 
 
 		 321 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  28.67 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 		 590 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  32.26 
 
 		 998 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.51 
 
 		 826 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1027 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 		 1272 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1390 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  29.73 
 
 		 163 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  35.85 
 
 		 870 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  31.13 
 
 		 1303 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  33.33 
 
 		 772 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  42.68 
 
 		 750 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  34.65 
 
 		 1428 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  30.57 
 
 		 791 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0726  protein of unknown function DUF1566  37.5 
 
 		 78 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.581112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  40 
 
 		 756 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  47  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  35.04 
 
 		 317 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1235  hypothetical protein  33.87 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 2886 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  28.67 
 
 		 172 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  29.45 
 
 		 181 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  29.32 
 
 		 190 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 1424 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  36.36 
 
 		 2239 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  32.87 
 
 		 166 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  27.78 
 
 		 179 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1022 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  30.15 
 
 		 917 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 665 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  45.9 
 
 		 1073 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  29.63 
 
 		 699 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>