21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0388 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  37.5 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  38.46 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  29.76 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  30.95 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  35.22 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  34.92 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  29.34 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  29.34 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  27.61 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  28.93 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  29.32 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  30.22 
 
 		 746 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  30.83 
 
 		 514 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  38.27 
 
 		 295 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  28.29 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  31.25 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  28.95 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  27.92 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  30.28 
 
 		 343 aa  42  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>