10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3364 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  55.62 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  55.62 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  40.74 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  32.68 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  32.53 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  28.66 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  27.88 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  25.47 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>