12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2002 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  98.08 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  55.56 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  40.48 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  29.27 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  34.21 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  24.19 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  26.16 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  31.4 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  28.08 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>