32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2072 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  40.35 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  38.26 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  34.32 
 
 		 245 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  34.25 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  36.11 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  37.35 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  38.95 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  32.68 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  38.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  32.17 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  36.09 
 
 		 746 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  35.34 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  34.59 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  53.75 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  34.92 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  33.07 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1123 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  36.78 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  31.21 
 
 		 337 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.87 
 
 		 514 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  32.28 
 
 		 299 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  35.06 
 
 		 343 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  27.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  34.48 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1022 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1152 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  33.33 
 
 		 591 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  33.72 
 
 		 571 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  28.07 
 
 		 316 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  25.97 
 
 		 1310 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>