32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3291 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  343  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  53.16 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  39.01 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  35.33 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  37.91 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  37.91 
 
 		 190 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  32.34 
 
 		 245 aa  87.8  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  33.12 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  33.12 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  33.55 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.11 
 
 		 746 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  33.33 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  29.17 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  34.26 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  35 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  35.44 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  29.75 
 
 		 343 aa  50.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1123 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1022 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  29.41 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1152 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  29.93 
 
 		 337 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 590 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.58 
 
 		 670 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  23.31 
 
 		 316 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  28.69 
 
 		 333 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  35.23 
 
 		 591 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  31.11 
 
 		 514 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  28.7 
 
 		 299 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>