25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03097 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  53.01 
 
 
165 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  35.98 
 
 
176 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  36.05 
 
 
179 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  35.95 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  34.62 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  40.8 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  32.43 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  38.93 
 
 
186 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  32.47 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  39.78 
 
 
212 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  39.78 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  32.91 
 
 
245 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  39.33 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  27.27 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  36.46 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  32.04 
 
 
317 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.29 
 
 
746 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.38 
 
 
670 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  37.66 
 
 
1152 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  34.25 
 
 
295 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  31.58 
 
 
1123 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  26.55 
 
 
333 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  30.15 
 
 
343 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  30.77 
 
 
316 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>