27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0741 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  65.93 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  48.52 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  48.72 
 
 		 1035 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  43.41 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  46.2 
 
 		 670 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  37.96 
 
 		 2002 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  35.14 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  34.02 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  39.58 
 
 		 1310 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  38.85 
 
 		 146 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  33.09 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  30.9 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  35.19 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  29.9 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  30.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  32.21 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  31.54 
 
 		 190 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  27.47 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0726  protein of unknown function DUF1566  38.04 
 
 		 78 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.581112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  28.39 
 
 		 172 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  34 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  29.93 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30.23 
 
 		 587 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 590 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  28.95 
 
 		 166 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1022 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>