27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1619 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  49.65 
 
 
333 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  46.81 
 
 
343 aa  258  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  38.94 
 
 
316 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  32.93 
 
 
2002 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.82 
 
 
670 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.32 
 
 
746 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  33.09 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  32.28 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.87 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  35.66 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  29.55 
 
 
172 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32.67 
 
 
409 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  31.3 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  37.01 
 
 
253 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.5 
 
 
1035 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  35.42 
 
 
499 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 
463 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  29.03 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  23.9 
 
 
1022 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  42.25 
 
 
130 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  30.86 
 
 
295 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  27.48 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  30.14 
 
 
181 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1048  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
814 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0726  protein of unknown function DUF1566  36.36 
 
 
78 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.581112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>