29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4088 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1502    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31.45 
 
 		 1736 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1802 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 		 1212 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1193 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  29.41 
 
 		 897 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.87 
 
 		 1073 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.4 
 
 		 2239 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 		 1192 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.48 
 
 		 1001 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  33.86 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  26.1 
 
 		 1029 aa  64.7  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1321 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  34.69 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.81 
 
 		 1109 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  27.31 
 
 		 1313 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 		 1424 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  37.14 
 
 		 1428 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35 
 
 		 1035 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  28.93 
 
 		 1236 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  37.61 
 
 		 1303 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2225  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1396 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142194  hitchhiker  0.00588885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.07 
 
 		 616 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  40 
 
 		 608 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  33.33 
 
 		 2002 aa  47.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  26.19 
 
 		 490 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  29.03 
 
 		 2207 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  31.58 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  25.43 
 
 		 1626 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>