30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4963 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  100 
 
 		 897 aa  1752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1802 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  30.26 
 
 		 1736 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.3 
 
 		 1073 aa  98.6  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  37.45 
 
 		 772 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.92 
 
 		 1212 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  29.66 
 
 		 2239 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  29.41 
 
 		 756 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  28.05 
 
 		 607 aa  73.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1193 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  38.52 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  28.21 
 
 		 1029 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  29.13 
 
 		 2690 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.62 
 
 		 1626 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 		 1192 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  39.8 
 
 		 1424 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.29 
 
 		 2207 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  39.24 
 
 		 2294 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  40.91 
 
 		 685 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.69 
 
 		 1001 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1321 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  35.64 
 
 		 586 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  32.35 
 
 		 1310 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  42.05 
 
 		 2002 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.34 
 
 		 1109 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.66 
 
 		 644 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.83 
 
 		 1035 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 1428 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1476  hypothetical protein  36.71 
 
 		 272 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.614774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  28.5 
 
 		 561 aa  45.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>