27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0343 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  100 
 
 		 1802 aa  3403    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0152  hypothetical protein  65.25 
 
 		 586 aa  175  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.621521  hitchhiker  0.000148726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  30.3 
 
 		 897 aa  167  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.72 
 
 		 1626 aa  127  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2225  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1396 aa  107  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142194  hitchhiker  0.00588885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.81 
 
 		 1212 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  33.57 
 
 		 756 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  28.4 
 
 		 1736 aa  97.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  24.5 
 
 		 2239 aa  92  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.23 
 
 		 1109 aa  89  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  30.67 
 
 		 1029 aa  85.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  30.81 
 
 		 772 aa  82  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.76 
 
 		 1001 aa  74.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  33.54 
 
 		 2207 aa  72.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1193 aa  69.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.61 
 
 		 1073 aa  69.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.99 
 
 		 2690 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  28.71 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  29.69 
 
 		 1236 aa  55.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  38.18 
 
 		 1428 aa  53.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  30.14 
 
 		 608 aa  52.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  39.64 
 
 		 1303 aa  52.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 		 1424 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.66 
 
 		 616 aa  46.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  39.58 
 
 		 586 aa  45.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  30.25 
 
 		 2169 aa  45.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>