90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2695 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  81.57 
 
 		 477 aa  736    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 483 aa  963    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.53 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  32.53 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  31.06 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  31.52 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  30.88 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  29.61 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.57 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  32.65 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  29.86 
 
 		 483 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  33.5 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  30.73 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  32.79 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.21 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  30.95 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  34.24 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  29.16 
 
 		 523 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.15 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  32.13 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  29.98 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  32.61 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  29.93 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  30.57 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  31.78 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  27.8 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.18 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  27.47 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  29.56 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.4 
 
 		 479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  31.68 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  31.5 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  29.84 
 
 		 439 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  31.05 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  29.72 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  30.29 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  30.13 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  29.94 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  31.48 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  30.91 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  29.69 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  29.33 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  30.56 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  31.58 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  30.39 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  31.42 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  30.25 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  31.57 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  29.9 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  29.57 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  31.28 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  29.76 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.03 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  28.87 
 
 		 496 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.01 
 
 		 673 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  27.13 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  34.92 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1318 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.02 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.65 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  33.49 
 
 		 852 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.54 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.3 
 
 		 591 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.66 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.14 
 
 		 2192 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  25.45 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.94 
 
 		 884 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  22.83 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  23.86 
 
 		 759 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  23.43 
 
 		 1296 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.35 
 
 		 1037 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.64 
 
 		 575 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  38.18 
 
 		 717 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  27.42 
 
 		 593 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 1332 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  27.49 
 
 		 1092 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  30.24 
 
 		 1619 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  30.09 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.05 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  34.45 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  26.62 
 
 		 1672 aa  48.5  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  25.96 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 817 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  24.57 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  35.96 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1010 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.22 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.4 
 
 		 591 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  27.03 
 
 		 2160 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>