78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0321 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  888    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  59.65 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  73.2 
 
 		 361 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  63.89 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.44 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  60.98 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  56.85 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  61.09 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.31 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  55.56 
 
 		 454 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.25 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  56.25 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  56.88 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  56.72 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  54.24 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  56.13 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  54.26 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55.75 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  56.22 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  53.4 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  57.17 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  53.1 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  54.29 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.83 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  52.08 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  53.88 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  54.7 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  53.35 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  54.29 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  47.83 
 
 		 505 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  52.16 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  53.24 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  53.88 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  53.17 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.89 
 
 		 462 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.7 
 
 		 464 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  52.28 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.29 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  50 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  55.78 
 
 		 415 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  49.48 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.84 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  52.09 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 		 476 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  48.51 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.62 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.9 
 
 		 509 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  42.46 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.37 
 
 		 481 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  40.34 
 
 		 483 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  43.21 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.03 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.5 
 
 		 523 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.44 
 
 		 532 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.15 
 
 		 477 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.53 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  41.71 
 
 		 840 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  35.42 
 
 		 673 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  35.94 
 
 		 759 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  45.05 
 
 		 168 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.35 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.71 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32.56 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.33 
 
 		 884 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  31.06 
 
 		 575 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.12 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  42.06 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.55 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.82 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  31.71 
 
 		 1037 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.5 
 
 		 1296 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1106 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  32.02 
 
 		 863 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.16 
 
 		 1197 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1318 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  24.55 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.36 
 
 		 572 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  41.56 
 
 		 2160 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>