52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1227 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  48.21 
 
 		 454 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  50 
 
 		 460 aa  91.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  49.55 
 
 		 452 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  41.96 
 
 		 468 aa  84.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  42.98 
 
 		 461 aa  84.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  46.43 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  45.54 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.64 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  47.32 
 
 		 459 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  53.85 
 
 		 435 aa  80.5  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  46.9 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  42.34 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  41.35 
 
 		 466 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  44.64 
 
 		 454 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.06 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  50.47 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  38.89 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  44.66 
 
 		 476 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.95 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  38.41 
 
 		 462 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  46.43 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  51.89 
 
 		 473 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  38.03 
 
 		 477 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.75 
 
 		 464 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  37.41 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  54.05 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  43.48 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  44.35 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  44.14 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  41.07 
 
 		 439 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  49.02 
 
 		 496 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  37.68 
 
 		 450 aa  71.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  42.86 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  35.29 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  40.17 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.7 
 
 		 465 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  36.5 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  37.82 
 
 		 461 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.88 
 
 		 462 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  37.68 
 
 		 462 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  32.76 
 
 		 432 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  52 
 
 		 441 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  36.69 
 
 		 415 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  47.3 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.14 
 
 		 448 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.12 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.39 
 
 		 509 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  35.58 
 
 		 477 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.79 
 
 		 483 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  28.77 
 
 		 481 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>