80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1623 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1100    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  62.18 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  64.79 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  60.8 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.57 
 
 		 479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  63.39 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  58.66 
 
 		 489 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  62.93 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.71 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  60.74 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  55.62 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  57.62 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  56.82 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  56.07 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  57.88 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  53.16 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  57.59 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  57.06 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  57.32 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  52.3 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.44 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  54.21 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.35 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.77 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.17 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.07 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  54.19 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  59.08 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  52.27 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  51.56 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  51.49 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  53.07 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.03 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  51.98 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  55.15 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  54.7 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  52.19 
 
 		 432 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  55.63 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.95 
 
 		 478 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  49.28 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  53.93 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  51.77 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  54.93 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  55.94 
 
 		 415 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  50.52 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  49.78 
 
 		 433 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.2 
 
 		 509 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.11 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.36 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.15 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.64 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  34.97 
 
 		 523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  40.05 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.86 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.56 
 
 		 477 aa  133  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  28.41 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  39.71 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  37.19 
 
 		 673 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.18 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.56 
 
 		 852 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  30.8 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  33.59 
 
 		 2160 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.52 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  27.64 
 
 		 1296 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.3 
 
 		 1037 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  29.71 
 
 		 1359 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.61 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  33.9 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1318 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.52 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.32 
 
 		 863 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  23.88 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.85 
 
 		 601 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1106 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.36 
 
 		 2192 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.38 
 
 		 593 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  41.94 
 
 		 417 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.14 
 
 		 884 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>