55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1788 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  64.71 
 
 		 799 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 1092 aa  2192    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  72.96 
 
 		 1332 aa  788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  79.4 
 
 		 1123 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  70.57 
 
 		 932 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  67.44 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  40.22 
 
 		 852 aa  300  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  43.14 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1106 aa  155  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  34.15 
 
 		 507 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.05 
 
 		 1296 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  33.42 
 
 		 1170 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1318 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  34.6 
 
 		 775 aa  131  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  30.66 
 
 		 1216 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1010 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1263 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  39.13 
 
 		 2192 aa  97.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 		 1526 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1055 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  32.41 
 
 		 417 aa  90.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  31.67 
 
 		 1755 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  32.11 
 
 		 441 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.77 
 
 		 2031 aa  70.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1750 aa  65.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  26.97 
 
 		 483 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  36.76 
 
 		 477 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  29.46 
 
 		 466 aa  57.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  32.47 
 
 		 467 aa  57  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  55.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  36.76 
 
 		 473 aa  54.7  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.2 
 
 		 509 aa  54.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  30.85 
 
 		 501 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  26.14 
 
 		 464 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  31.03 
 
 		 465 aa  52.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  35.45 
 
 		 5453 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  30.07 
 
 		 450 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  30.43 
 
 		 466 aa  51.6  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  29 
 
 		 468 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.01 
 
 		 505 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  37.85 
 
 		 523 aa  50.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  27.56 
 
 		 454 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  32.56 
 
 		 454 aa  50.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  49.3  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  28.17 
 
 		 461 aa  48.9  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.57 
 
 		 512 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  26.87 
 
 		 483 aa  48.5  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  26.26 
 
 		 476 aa  48.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.52 
 
 		 884 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  32.11 
 
 		 459 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  30.11 
 
 		 435 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  28.57 
 
 		 361 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1066 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>