19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1791 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1349    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  71.57 
 
 
932 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  72.76 
 
 
1332 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  71.43 
 
 
799 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  67.44 
 
 
1092 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  62.86 
 
 
1123 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  45.2 
 
 
667 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  46.88 
 
 
702 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  47.88 
 
 
1898 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  39.66 
 
 
703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  45.24 
 
 
719 aa  107  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  42.77 
 
 
702 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  43.75 
 
 
714 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  41.07 
 
 
713 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  39.51 
 
 
703 aa  90.9  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  32.97 
 
 
1147 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  35.11 
 
 
621 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  33.94 
 
 
1154 aa  47.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  29.17 
 
 
808 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>