25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2515 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  881    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  33.41 
 
 
2192 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  35.55 
 
 
852 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  38.05 
 
 
1010 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  35.8 
 
 
1106 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.3 
 
 
1332 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  32.2 
 
 
799 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  32.21 
 
 
1318 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.28 
 
 
743 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  32.87 
 
 
417 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  30.38 
 
 
350 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  26.88 
 
 
775 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.25 
 
 
507 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  33.48 
 
 
1296 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  28.12 
 
 
1263 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  26.51 
 
 
1170 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.55 
 
 
1526 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  24.85 
 
 
1216 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  32.93 
 
 
1092 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  28.46 
 
 
1055 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  35.19 
 
 
5453 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.95 
 
 
1037 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  36.14 
 
 
563 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.94 
 
 
1750 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>