23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1920 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  851    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  45.11 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  38.06 
 
 		 852 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1263 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  39.38 
 
 		 1526 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  35.38 
 
 		 1332 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  40.64 
 
 		 1010 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  38.65 
 
 		 1106 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  38.27 
 
 		 799 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1055 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 2192 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  33.5 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  32.05 
 
 		 507 aa  96.3  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  33.46 
 
 		 743 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.79 
 
 		 1296 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1318 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  37.62 
 
 		 1092 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  45.05 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.48 
 
 		 1755 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  28.46 
 
 		 1216 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  27.91 
 
 		 775 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  24.52 
 
 		 1170 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  38.67 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>