29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1789 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 1123 aa  2313    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  79.4 
 
 		 1092 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  70 
 
 		 799 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  68.77 
 
 		 1332 aa  439  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  66.99 
 
 		 932 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  62.86 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  35.42 
 
 		 1545 aa  158  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.67 
 
 		 1181 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.58 
 
 		 1245 aa  105  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.88 
 
 		 1223 aa  100  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  33.16 
 
 		 1544 aa  87.4  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  40.6 
 
 		 1309 aa  79.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.55 
 
 		 1155 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.72 
 
 		 1287 aa  77.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 1200 aa  76.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.53 
 
 		 1227 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.14 
 
 		 1158 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  26.77 
 
 		 1327 aa  65.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.69 
 
 		 1154 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3936  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1340 aa  52  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  27.52 
 
 		 597 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.87 
 
 		 950 aa  50.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  29.09 
 
 		 592 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  28.97 
 
 		 599 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  30.53 
 
 		 582 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.84 
 
 		 1218 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  34.18 
 
 		 717 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  29.81 
 
 		 668 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  30.85 
 
 		 1254 aa  45.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>