116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1902 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.52 
 
 		 938 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  24.69 
 
 		 873 aa  169  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.29 
 
 		 1222 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1245 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  27.79 
 
 		 3682 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1228 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30 
 
 		 1313 aa  90.9  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  28.8 
 
 		 496 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  33.61 
 
 		 490 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  28.38 
 
 		 2972 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1488 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  27.68 
 
 		 1140 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  25.06 
 
 		 3851 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.44 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  40.86 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.76 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.46 
 
 		 4071 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.18 
 
 		 2833 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  38.21 
 
 		 890 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  34.09 
 
 		 886 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  31.06 
 
 		 658 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.04 
 
 		 3542 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  26.48 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  40 
 
 		 799 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  30.89 
 
 		 652 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  32.17 
 
 		 2980 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.65 
 
 		 822 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.56 
 
 		 1230 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1287 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  35.24 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  38.17 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.92 
 
 		 1345 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  35.16 
 
 		 1606 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.52 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.6 
 
 		 1371 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  32 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  26.82 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  23.99 
 
 		 662 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  35.4 
 
 		 1389 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.15 
 
 		 1602 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  30.88 
 
 		 1466 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.55 
 
 		 750 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.75 
 
 		 1162 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.68 
 
 		 794 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.07 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.34 
 
 		 1620 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25 
 
 		 1266 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.76 
 
 		 3793 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.65 
 
 		 2713 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  30.53 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.74 
 
 		 5745 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.65 
 
 		 2270 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.25 
 
 		 2807 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 885 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  32 
 
 		 808 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1259 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.25 
 
 		 2454 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2411 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  31.25 
 
 		 1463 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.86 
 
 		 1987 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  25.09 
 
 		 689 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2367 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2421 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1329 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  32.56 
 
 		 540 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.83 
 
 		 503 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  22.67 
 
 		 535 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  28.14 
 
 		 749 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  23.96 
 
 		 1288 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1163 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  30.14 
 
 		 969 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  30.14 
 
 		 963 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.4 
 
 		 637 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.63 
 
 		 4896 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  30.87 
 
 		 950 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  27.91 
 
 		 2064 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  31.18 
 
 		 598 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  34 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.65 
 
 		 2377 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.01 
 
 		 1657 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  31.85 
 
 		 676 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  25.99 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  26.53 
 
 		 581 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  22.82 
 
 		 6497 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  23.74 
 
 		 774 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.93 
 
 		 3471 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.46 
 
 		 3227 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  29.73 
 
 		 968 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  29.03 
 
 		 541 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1634 aa  47.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.99 
 
 		 2364 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  32.99 
 
 		 860 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1139 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  48.78 
 
 		 3324 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  27.5 
 
 		 534 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  33.68 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.63 
 
 		 532 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.94 
 
 		 711 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>